Český webový server pomáhá hledat dnes již neexistující proteiny

Novou webovou aplikaci, která pomáhá vědcům při tzv. ancestrální rekonstrukci, vyvinuli výzkumníci z Ústavu informačních systémů FIT ve spolupráci s Mezinárodním centrem klinického výzkumu (ICRC) Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně a Loschmidtovými laboratořemi Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity. Tam metodu využívají ke studiu molekulární evoluce a hledání prastarých, dnes již neexistujících, proteinů, ze kterých se ty současné vyvinuly. To může v budoucnu pomoct např. ve farmakologii, medicíně či biotechnologii.

„Webová služba FireProt-ASR jako jediná dovoluje uživatelům provést ancestrální rekonstrukci s využitím pouze jediné startovní sekvence. Program je plně automatizovaný, je tedy vhodný i pro začátečníky, uživatel navíc může použít vlastní data a zahájit výpočet z různých částí výpočetního prostředí,“ vysvětlil Miloš Musil z FIT, který na vývoji serveru pracoval. Více si můžete o projektu přečíst na stránkách ICRC nebo v odborném časopise Briefings in bioinformatics. Nástroj je dostupný na stránkách Loschmidtových laboratoří.

Zdroj: VUT